Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc27Q3V036 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc27Q3V036 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc27Q3V036 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms