Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a11Q3USY0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms