Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Acsf3Q3URE1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acsf3Q3URE1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms