Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mtcl1Q3UHU5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mtcl1Q3UHU5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms