Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Carmil3Q3UFQ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil3Q3UFQ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms