Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Yipf3Q3UDR8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Yipf3Q3UDR8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms