Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trafd1Q3UDK1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trafd1Q3UDK1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms