Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atxn7l3bQ3UD01 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atxn7l3bQ3UD01 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms