Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trip13Q3UA06 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trip13Q3UA06 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trip13Q3UA06 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms