Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf180Q3U827 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf180Q3U827 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf180Q3U827 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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