Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Gtpbp6Q3U6U5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
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Gtpbp6Q3U6U5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtpbp6Q3U6U5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtpbp6Q3U6U5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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