Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
YrdcQ3U5F4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YrdcQ3U5F4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms