Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1Y4

Dennd4b, DENN domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dennd4bQ3U1Y4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dennd4bQ3U1Y4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dennd4bQ3U1Y4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dennd4bQ3U1Y4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms