Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ankrd33bQ3U0L2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ankrd33bQ3U0L2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms