Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Hbq1bQ3U0A6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Hbq1bQ3U0A6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Hbq1bQ3U0A6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Hbq1bQ3U0A6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Hbq1bQ3U0A6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hbq1bQ3U0A6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hbq1bQ3U0A6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hbq1bQ3U0A6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hbq1bQ3U0A6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hbq1bQ3U0A6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hbq1bQ3U0A6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms