Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt2Q3TTY5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt2Q3TTY5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms