Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TTJ4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3TTJ4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms