Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctdnep1Q3TP92 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms