Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc102aQ3TMW1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc102aQ3TMW1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms