Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrx1Q3TL44 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nlrx1Q3TL44 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrx1Q3TL44 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms