Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp39Q3TIX9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp39Q3TIX9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms