Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trappc13Q3TIR1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trappc13Q3TIR1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms