Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VrtnQ3SYK4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VrtnQ3SYK4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms