Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3KNL4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3KNL4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3KNL4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3KNL4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms