Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm3Q32NY4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms