Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M3Q31093 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-M3Q31093 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms