Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIS4

Flg2, Filaggrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flg2Q2VIS4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Flg2Q2VIS4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Flg2Q2VIS4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Flg2Q2VIS4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Flg2Q2VIS4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Flg2Q2VIS4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Flg2Q2VIS4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Flg2Q2VIS4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Flg2Q2VIS4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Flg2Q2VIS4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Flg2Q2VIS4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Flg2Q2VIS4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms