Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chrna5Q2MKA5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chrna5Q2MKA5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chrna5Q2MKA5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms