Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1aQ2LKU9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1aQ2LKU9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms