Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne9Q1RLL3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne9Q1RLL3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms