Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptcd3Q14C51 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ptcd3Q14C51 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ptcd3Q14C51 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptcd3Q14C51 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptcd3Q14C51 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptcd3Q14C51 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptcd3Q14C51 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptcd3Q14C51 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptcd3Q14C51 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms