Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VgfQ0VGU4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VgfQ0VGU4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VgfQ0VGU4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms