Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp4r2Q0VGB7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms