Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ttc39dQ0VF76 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ttc39dQ0VF76 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Ttc39dQ0VF76 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Ttc39dQ0VF76 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ttc39dQ0VF76 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc39dQ0VF76 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms