Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam83bQ0VBM2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam83bQ0VBM2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam83bQ0VBM2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms