Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rab42Q0PD08 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab42Q0PD08 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms