Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neurl1bQ0MW30 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neurl1bQ0MW30 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Neurl1bQ0MW30 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neurl1bQ0MW30 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neurl1bQ0MW30 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neurl1bQ0MW30 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Neurl1bQ0MW30 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Neurl1bQ0MW30 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Neurl1bQ0MW30 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms