Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TrioQ0KL02 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TrioQ0KL02 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms