Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf541Q0GGX2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf541Q0GGX2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms