Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc4Q08624 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc4Q08624 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms