Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tff1Q08423 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tff1Q08423 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms