Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn1Q08091 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms