Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Col9a2Q07643 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Col9a2Q07643 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms