Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf3Q07104 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf3Q07104 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms