Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SrstQ06666 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms