Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cab39Q06138 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cab39Q06138 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms