Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc2Q05020 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms