Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox10Q04888 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox10Q04888 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox10Q04888 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms