Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox9Q04887 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sox9Q04887 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sox9Q04887 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms