Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Emx2Q04744 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Emx2Q04744 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms